19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29269 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  100 
 
 		 656 aa  1323    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  38.43 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  27.31 
 
 		 719 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  25.29 
 
 		 690 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31744  predicted protein  25.8 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743293  normal  0.568196 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28340  Leucine rich repeat protein  25.96 
 
 		 704 aa  140  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.669391  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31745  predicted protein  24.31 
 
 		 660 aa  137  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442814  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  24.23 
 
 		 677 aa  130  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28339  hypothetical protein  25.53 
 
 		 559 aa  100  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.0915689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 444 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  34.06 
 
 		 755 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  23.91 
 
 		 1263 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  24.87 
 
 		 713 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 		 755 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 755 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 731 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  26.03 
 
 		 630 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>