More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_51609 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_51609  predicted protein  100 
 
 
529 aa  1080    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73669  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3820  predicted protein  35.71 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 
416 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 
405 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  28.76 
 
 
414 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  26.37 
 
 
543 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  25.43 
 
 
403 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 
404 aa  157  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  27.73 
 
 
429 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.25 
 
 
404 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.25 
 
 
404 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.25 
 
 
404 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  28.25 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.71 
 
 
404 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.48 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  27.48 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.71 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 
413 aa  153  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.02 
 
 
404 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 
413 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.48 
 
 
404 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  28.57 
 
 
407 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  27.72 
 
 
411 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  28.76 
 
 
426 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  28.2 
 
 
404 aa  150  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  27.65 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.42 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  27.29 
 
 
404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  28.1 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  27.27 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 
418 aa  148  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
410 aa  148  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.31 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.31 
 
 
545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.56 
 
 
404 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  24.6 
 
 
508 aa  147  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  28.54 
 
 
400 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 
409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  26.67 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 
409 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.08 
 
 
546 aa  146  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.06 
 
 
415 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  29.05 
 
 
412 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  27.65 
 
 
429 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  27.65 
 
 
429 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  28.37 
 
 
422 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  27.52 
 
 
428 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  26.34 
 
 
404 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  27.52 
 
 
428 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  27.52 
 
 
428 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  26.33 
 
 
406 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  24.34 
 
 
404 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  27.91 
 
 
429 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  27.82 
 
 
404 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  25.17 
 
 
404 aa  143  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  25.87 
 
 
404 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  27.42 
 
 
426 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 
423 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  30.85 
 
 
423 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  27.21 
 
 
406 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  26.83 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  26.48 
 
 
392 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  27.38 
 
 
404 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  25 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  26.35 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
432 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 
404 aa  140  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  26.37 
 
 
410 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  24.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 
404 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 
404 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.68 
 
 
518 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  26.71 
 
 
392 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  25.82 
 
 
410 aa  139  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  26.51 
 
 
404 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  26.51 
 
 
404 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 
406 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  25.93 
 
 
410 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  24.82 
 
 
395 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 
409 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 
395 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  27.75 
 
 
404 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 
395 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  25.6 
 
 
395 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 
395 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  25.6 
 
 
395 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  26.68 
 
 
405 aa  137  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 
403 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.06 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  26.05 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  26.05 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>