22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46460 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  100 
 
 		 1448 aa  2999    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  37.46 
 
 		 1183 aa  189  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  43.27 
 
 		 228 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  31.37 
 
 		 1154 aa  169  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  34.52 
 
 		 1183 aa  157  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  32.21 
 
 		 723 aa  79.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  29.47 
 
 		 299 aa  64.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  33.52 
 
 		 163 aa  63.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  31.88 
 
 		 189 aa  61.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  32.58 
 
 		 271 aa  60.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  32.48 
 
 		 183 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  27.4 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  25.53 
 
 		 417 aa  58.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  29.88 
 
 		 578 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  29.83 
 
 		 655 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  31.82 
 
 		 369 aa  51.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  28 
 
 		 532 aa  49.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  33.33 
 
 		 696 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  28.85 
 
 		 172 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  25 
 
 		 278 aa  47.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  23.02 
 
 		 315 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  28.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>