194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45955 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45955  predicted protein  100 
 
 
441 aa  924    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48602  predicted protein  26.26 
 
 
582 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29370  predicted sulfurtransferase  26.18 
 
 
303 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44443  predicted protein  25.06 
 
 
524 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0616  hypothetical protein  24.8 
 
 
304 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  25.48 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18110  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  97.1  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.022493  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47291  predicted protein  28.12 
 
 
475 aa  96.7  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3153  hypothetical protein  25.48 
 
 
297 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.860693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  27.01 
 
 
328 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3365  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43411  predicted protein  29.03 
 
 
279 aa  90.1  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.140285 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  24.91 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  26.59 
 
 
320 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  24.35 
 
 
314 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1671  Rhodanese domain protein  27.84 
 
 
321 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2977  Rhodanese domain protein  24.44 
 
 
278 aa  86.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  25.27 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0905  rhodanese domain-containing protein  29.44 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27003  predicted protein  30.77 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000114897  normal  0.0765479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  25.53 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  31.02 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  32.54 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03470  hypothetical protein  27.46 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.909534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  25.65 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  26.24 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  36.72 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  22.92 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  23.99 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
346 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  28.72 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  24.2 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  24.68 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  24.52 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  28.34 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  30.37 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50174  predicted protein  26.86 
 
 
906 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  26.43 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  33.53 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  33.53 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2691  hypothetical protein  26.86 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  23.63 
 
 
319 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  31.52 
 
 
319 aa  77  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  26.42 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0918  hypothetical protein  26.55 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0883214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  23.21 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  24.77 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  30.93 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1744  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.216312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1719  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1694  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  29.05 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1881  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1916  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000576752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  31.67 
 
 
314 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1875  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  25.24 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  30.57 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  27.14 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  31.55 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  32.05 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  29.9 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  31.54 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  27.83 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  29.05 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  28.72 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  34.92 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  29.48 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  28.41 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  28.32 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 
555 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  28.74 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  25.82 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  30.64 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  22.91 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  22.91 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  24.59 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  23.45 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  31.55 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  31.69 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  29.65 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  23.98 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  30.07 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  29.11 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  32.54 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  23.8 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  31.69 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  25.45 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  29.65 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  29.65 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  31.16 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  33.53 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  29.65 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  31.16 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  29.65 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>