More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43253 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43253  predicted protein  100 
 
 
539 aa  1127    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  49.34 
 
 
248 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  48.23 
 
 
252 aa  233  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  50.22 
 
 
249 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  49.78 
 
 
251 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
250 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  50.22 
 
 
247 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 
248 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  48.46 
 
 
247 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  49.34 
 
 
247 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.02 
 
 
250 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  48.02 
 
 
247 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  48.9 
 
 
247 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.46 
 
 
247 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  46.81 
 
 
253 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  48.46 
 
 
247 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  48.46 
 
 
247 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  48.02 
 
 
247 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 
306 aa  224  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  48.46 
 
 
247 aa  223  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  47.14 
 
 
248 aa  223  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  48 
 
 
251 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 
293 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  48.02 
 
 
247 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
250 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
250 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
250 aa  220  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
250 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
250 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  46.69 
 
 
249 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
250 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  48.02 
 
 
247 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  47.58 
 
 
248 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  47.98 
 
 
247 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  46.72 
 
 
247 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.67 
 
 
250 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
245 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  46.93 
 
 
248 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
247 aa  216  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  48.02 
 
 
234 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  48.46 
 
 
234 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  47.58 
 
 
247 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.7 
 
 
250 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  47.14 
 
 
247 aa  216  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  46.7 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  43.2 
 
 
247 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
249 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  45.89 
 
 
246 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  46.46 
 
 
248 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
251 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 
251 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 
270 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 
270 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
250 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  46.26 
 
 
249 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0335  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.37 
 
 
258 aa  213  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.96 
 
 
248 aa  213  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
245 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  45.61 
 
 
247 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
245 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
245 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 
250 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
230 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42857  phosphoglycerate mutase  43.57 
 
 
888 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
245 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  45.22 
 
 
251 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
248 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
245 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
245 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
245 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 
270 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
245 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  48 
 
 
227 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 
270 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
248 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
250 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  44.59 
 
 
248 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  45.65 
 
 
248 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  46.46 
 
 
248 aa  211  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
245 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48 
 
 
255 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
249 aa  211  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
248 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  45.37 
 
 
248 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
248 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
245 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
248 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
250 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
250 aa  210  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
247 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  44.2 
 
 
250 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>