23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42822 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  100 
 
 
837 aa  1742    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  49.32 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  51.02 
 
 
1474 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  44.83 
 
 
844 aa  67  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  48.98 
 
 
1041 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  50 
 
 
705 aa  64.7  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  42.86 
 
 
1544 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  42.86 
 
 
1544 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  29.89 
 
 
1717 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
1858 aa  61.6  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  35.06 
 
 
462 aa  58.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  31.67 
 
 
784 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 
940 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  46.67 
 
 
614 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
651 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
518 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  41.67 
 
 
841 aa  51.6  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  37.5 
 
 
2344 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  32.17 
 
 
444 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27481  predicted protein  25.77 
 
 
794 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27410  predicted protein  25.77 
 
 
794 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.294058 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92541  predicted protein  31.25 
 
 
824 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.707438  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89717  predicted protein  33.85 
 
 
383 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0641021  normal  0.293302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>