42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42552 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42552  predicted protein  100 
 
 
526 aa  1078    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45206  predicted protein  41.58 
 
 
538 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0786919  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31764  predicted protein  35.45 
 
 
548 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47952  predicted protein  37.62 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.870123  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44099  heat shock factor, DNA-binding  33.33 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52958  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48325  predicted protein  32.67 
 
 
670 aa  70.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50481  predicted protein  35 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44586  predicted protein  32.5 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48394  predicted protein  34.95 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48572  predicted protein  34.62 
 
 
339 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253588  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44917  predicted protein  33.91 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48361  predicted protein  30 
 
 
454 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49147  predicted protein  33.62 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401569  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45559  predicted protein  28.33 
 
 
357 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42714  predicted protein  31.68 
 
 
580 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45816  predicted protein  30.77 
 
 
690 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45560  predicted protein  34.58 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918277  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43413  predicted protein  32.35 
 
 
276 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515981  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43364  predicted protein  26.7 
 
 
285 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34415  predicted protein  29.81 
 
 
387 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37052  predicted protein  28.74 
 
 
159 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55070  DNA-binding heat shock factor  32.69 
 
 
387 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000184897  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39785  predicted protein  32.35 
 
 
320 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50136  predicted protein  30 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49566  predicted protein  30.25 
 
 
424 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.088371  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49136  predicted protein  28.43 
 
 
433 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43363  predicted protein  29.13 
 
 
367 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45392  predicted protein  27.66 
 
 
395 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0032411  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  31.37 
 
 
1106 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49557  predicted protein  31.31 
 
 
400 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899622  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48558  predicted protein  32.35 
 
 
468 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45926  predicted protein  29.52 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0314663  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49596  predicted protein  33.33 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000230021  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45393  predicted protein  25 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000938939  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45389  predicted protein  25.54 
 
 
417 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0399784  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50621  predicted protein  27.88 
 
 
420 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48667  predicted protein  30.85 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236073  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49620  predicted protein  28.26 
 
 
280 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45561  predicted protein  27.83 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.224  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39786  predicted protein  27.96 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48702  predicted protein  29.03 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49594  predicted protein  28.24 
 
 
403 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.853925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>