27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33738 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  100 
 
 
286 aa  597  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  32.24 
 
 
409 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  27.92 
 
 
515 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  33.47 
 
 
375 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  32.52 
 
 
373 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
373 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  31.11 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  27.27 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  28.03 
 
 
322 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  31.14 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  28.79 
 
 
389 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  31.7 
 
 
337 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  28.79 
 
 
389 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  28.79 
 
 
414 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  28.52 
 
 
358 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  29.92 
 
 
358 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  29.28 
 
 
339 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  27.71 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  26.84 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  26.14 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  30.54 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  29.35 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  26.34 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 
478 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  25.55 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 
392 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  25.62 
 
 
318 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.717122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>