31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30394 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  100 
 
 
559 aa  1140    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  54.28 
 
 
390 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  37.2 
 
 
204 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  35.17 
 
 
494 aa  123  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  25.56 
 
 
445 aa  64.3  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50269  predicted protein  39.56 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0183944  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  39.73 
 
 
1258 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  29.35 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.59 
 
 
548 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  30.07 
 
 
502 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03630  protein binding protein, putative  40 
 
 
1978 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326559  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04270  Actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5B0]  36 
 
 
1484 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.441373  normal  0.020853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  27.17 
 
 
529 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.59 
 
 
585 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01023  Actin cytoskeleton-regulatory complex protein end3 (Endocytosis protein 3)(Cytoskeletal adapter protein sagA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEK7]  32.63 
 
 
404 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.44 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00600  endocytosis-related protein, putative  40.32 
 
 
1601 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.83 
 
 
587 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24 
 
 
610 aa  51.6  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55255  protein involved in actin organization and endocytosis  38.67 
 
 
1373 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25 
 
 
546 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42442  predicted protein  35.71 
 
 
980 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.32 
 
 
620 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  28.22 
 
 
589 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.76 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.83 
 
 
564 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35192  Increased rDNA silencing protein  37.29 
 
 
628 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0269052  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  23.94 
 
 
1164 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65016  predicted protein  32.35 
 
 
384 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133626  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.92 
 
 
615 aa  43.5  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>