More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1913 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 128 aa  263  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  78.4 
 
 		 127 aa  210  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  79.82 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  75.42 
 
 		 135 aa  193  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  70.63 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  72.88 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  79.82 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  59.09 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  73.81 
 
 		 131 aa  163  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  58.27 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 127 aa  156  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  52.71 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  57.66 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  52.42 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  51.2 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  58.41 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  52.46 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  53.97 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  51.64 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  51.64 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  51.64 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  57.66 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  50.41 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>