More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1768 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  59.41 
 
 
512 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  100 
 
 
513 aa  1058    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  57.81 
 
 
513 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  60.98 
 
 
512 aa  660    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  57.53 
 
 
512 aa  644    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  59.88 
 
 
513 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  56.56 
 
 
514 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  59.8 
 
 
511 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  58.71 
 
 
512 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  60.2 
 
 
512 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  56.53 
 
 
513 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.84 
 
 
509 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  53.54 
 
 
510 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  51.87 
 
 
509 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 
512 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  50.78 
 
 
513 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  51.37 
 
 
509 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  51.47 
 
 
508 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 
509 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  51.18 
 
 
509 aa  525  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
509 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 
509 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 
509 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  52.51 
 
 
518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 
510 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  52.51 
 
 
518 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
508 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  51.16 
 
 
516 aa  510  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  48.82 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  49.41 
 
 
509 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  51.16 
 
 
518 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  51.54 
 
 
518 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  48.74 
 
 
512 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  47.24 
 
 
509 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
511 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  46.69 
 
 
512 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 
516 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  47.56 
 
 
511 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  49.01 
 
 
506 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  47.38 
 
 
511 aa  481  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  48.21 
 
 
507 aa  472  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  47.37 
 
 
505 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.25 
 
 
504 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  46.95 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  46.43 
 
 
506 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  46.27 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  48.44 
 
 
514 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  44.64 
 
 
520 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 
506 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  48.8 
 
 
496 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.45 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  45.85 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  45.97 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  44.9 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.62 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  44.44 
 
 
506 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  47.81 
 
 
504 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 
509 aa  450  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  45.02 
 
 
554 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  47.1 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  44.29 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  45.97 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  45.9 
 
 
508 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.8 
 
 
485 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  49.12 
 
 
512 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  44.09 
 
 
501 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  47.02 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  46.5 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  42.32 
 
 
504 aa  435  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  45.21 
 
 
507 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  44.69 
 
 
506 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  46.98 
 
 
506 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  47.09 
 
 
512 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  47.96 
 
 
504 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  48.81 
 
 
502 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  45.97 
 
 
510 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  46.73 
 
 
502 aa  428  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  46.75 
 
 
511 aa  429  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  46.37 
 
 
506 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  43.85 
 
 
519 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  44.47 
 
 
502 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  48.05 
 
 
510 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 
501 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  43.79 
 
 
498 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  46.65 
 
 
510 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  46.47 
 
 
505 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  45.47 
 
 
504 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  45.29 
 
 
530 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  46.39 
 
 
510 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  46.67 
 
 
512 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.25 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  45.84 
 
 
512 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  47.24 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  44.53 
 
 
509 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.8 
 
 
497 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  46.51 
 
 
512 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  45.31 
 
 
507 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  47.72 
 
 
529 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  45.54 
 
 
512 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>