54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0201 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  44.66 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  37.01 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  41.25 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  33.09 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  32.79 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  35.45 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  39.47 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  33.83 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  46.43 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  38.46 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  32.1 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.47 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  34.15 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0447  ribonuclease P protein component  32.76 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  37.97 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  31.82 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  31.87 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  31.87 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  31.87 
 
 		 108 aa  43.5  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  30.65 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2762  ribonuclease P protein component  30.38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000340802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  44.44 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  46.67 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  37.18 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  34.09 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  32.1 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  35.44 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  29.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  32.47 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  32.47 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  34.48 
 
 		 125 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  34.48 
 
 		 125 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>