39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4567 on replicon NC_011727
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  85.47 
 
 
517 aa  896    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  100 
 
 
918 aa  1905    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  70.47 
 
 
517 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4600  Relaxase/mobilization nuclease family protein  97.22 
 
 
281 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  40.73 
 
 
319 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  37.14 
 
 
828 aa  207  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011082  SeHA_B0003  mobilization protein MbeA  34.91 
 
 
524 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3938  hypothetical protein  33.33 
 
 
419 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0452  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.28 
 
 
457 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1283  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.69 
 
 
493 aa  140  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00213764  n/a   
 
 
-
 
NC_009791  EcE24377A_A0003  mobilization protein MobA  32.47 
 
 
521 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0002  mobilization protein MbeA  32.08 
 
 
517 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0005  mobilization protein  30.34 
 
 
535 aa  125  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1365  mobilization protein  28.7 
 
 
621 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0781  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.81 
 
 
496 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299304  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2404  hypothetical protein  31.29 
 
 
348 aa  108  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  29.01 
 
 
632 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  25.68 
 
 
455 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  25.16 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  24.3 
 
 
322 aa  70.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  26.55 
 
 
608 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  23.42 
 
 
325 aa  67.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  22.94 
 
 
327 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  24.18 
 
 
402 aa  61.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  27.98 
 
 
755 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  22.95 
 
 
296 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  29.94 
 
 
320 aa  58.9  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  22.98 
 
 
308 aa  58.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  22.32 
 
 
343 aa  57.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.3 
 
 
1019 aa  56.2  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  21.98 
 
 
319 aa  55.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  22.08 
 
 
311 aa  54.7  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  27.56 
 
 
344 aa  54.3  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  28.1 
 
 
631 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  25.33 
 
 
297 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  26.2 
 
 
311 aa  51.2  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  23.86 
 
 
311 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  25.38 
 
 
306 aa  46.2  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.7 
 
 
610 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>