15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_A0003 on replicon NC_009791
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009791  EcE24377A_A0003  mobilization protein MobA  100 
 
 		 521 aa  1057    Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0002  mobilization protein MbeA  90.72 
 
 		 517 aa  928    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011082  SeHA_B0003  mobilization protein MbeA  61.7 
 
 		 524 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1365  mobilization protein  36.61 
 
 		 621 aa  177  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0005  mobilization protein  37.31 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  33.21 
 
 		 918 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2404  hypothetical protein  33.98 
 
 		 348 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4600  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.33 
 
 		 281 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3938  hypothetical protein  32.79 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255208 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.81 
 
 		 828 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0452  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.4 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1283  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.39 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00213764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0781  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.78 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299304  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0037  relaxase  24.57 
 
 		 1065 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>