48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5254 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
447 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.98 
 
 
457 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  64.98 
 
 
457 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  53.2 
 
 
1844 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.84 
 
 
1016 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.05 
 
 
396 aa  345  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.45 
 
 
672 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.14 
 
 
424 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.05 
 
 
411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  41.75 
 
 
394 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.09 
 
 
398 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  44.96 
 
 
705 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.2 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.83 
 
 
396 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.2 
 
 
401 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  40.35 
 
 
410 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.44 
 
 
394 aa  262  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  39.01 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  34.1 
 
 
454 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  36.1 
 
 
472 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  34.08 
 
 
454 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  35.49 
 
 
464 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  33.26 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  31.5 
 
 
374 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  31.22 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 
341 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.57 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  31.2 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  31.2 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  44.79 
 
 
98 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5068  protein of unknown function DUF839  55.36 
 
 
463 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  30.86 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0490  hypothetical protein  78.57 
 
 
193 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4419  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.71 
 
 
229 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.26 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0556  protein of unknown function DUF1555  65.52 
 
 
246 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5137  hypothetical protein  54.05 
 
 
219 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000391037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4063  hypothetical protein  63.33 
 
 
195 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  47.92 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1999  Proprotein convertase P  55.88 
 
 
209 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  63.33 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3228  hypothetical protein  65.52 
 
 
209 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2726  hypothetical protein  56.67 
 
 
243 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2724  hypothetical protein  56.67 
 
 
243 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2725  hypothetical protein  56.67 
 
 
239 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2173  hypothetical protein  64.29 
 
 
299 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2235  hypothetical protein  64.29 
 
 
278 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2180  hypothetical protein  35.82 
 
 
242 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>