19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3879 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  33.18 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  25.24 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  24.92 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  25 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  24.67 
 
 		 706 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  29.65 
 
 		 696 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  35.56 
 
 		 589 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  23.36 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.19 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  52.63 
 
 		 367 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  48.44 
 
 		 677 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  20.06 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  44.62 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  23.26 
 
 		 666 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  32.93 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  38.46 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  28.05 
 
 		 520 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  44.93 
 
 		 524 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>