40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2669 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  47.22 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  45.71 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  44.93 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  49.25 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  46.38 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  43.66 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  43.28 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  40.28 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  37.5 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  37.5 
 
 		 76 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  54.35 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  43.06 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  42.25 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  39.73 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  32.86 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  40.28 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  38.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  37.68 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  36.99 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  37.14 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  37.14 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  36 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_1660  YcfA family protein  32.81 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5959  YcfA family protein  35.62 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489915  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  38.98 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1678  YcfA family protein  32.81 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.830575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  43.48 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3110  hypothetical protein  34.78 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  41.82 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0444  YcfA family protein  38.71 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0267733 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2138  hypothetical protein  32.76 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0848  YcfA family protein  36.62 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.230589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>