More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3864 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  100 
 
 		 295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  98.64 
 
 		 295 aa  594  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  87.5 
 
 		 297 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  74.83 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  73.93 
 
 		 295 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  72.53 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  69.6 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  62.59 
 
 		 285 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  62.41 
 
 		 277 aa  361  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  62.95 
 
 		 285 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  61.4 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  60.95 
 
 		 277 aa  351  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  60.22 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  62.41 
 
 		 285 aa  349  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  60.95 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  61.31 
 
 		 277 aa  347  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  61.17 
 
 		 277 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  60.65 
 
 		 287 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  60.95 
 
 		 284 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  60.22 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  60.14 
 
 		 280 aa  334  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  61.03 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  61.03 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  60.29 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  60.07 
 
 		 279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  57.66 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  60.44 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  55.91 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  54.64 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  54.42 
 
 		 304 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  54.84 
 
 		 301 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  54.29 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.64 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  53.9 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  53.9 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  53.9 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  53.96 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  53.05 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.31 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  53.9 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  51.94 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  55.02 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  48.39 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  54.28 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  45.02 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  49.64 
 
 		 276 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  48.08 
 
 		 543 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.24 
 
 		 351 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  45.79 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.5 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 543 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 320 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 539 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.68 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 		 325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.07 
 
 		 353 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  43.38 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 		 350 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8931  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 		 345 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2471  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.595085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2787  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.77 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.24 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.44 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.17 
 
 		 323 aa  228  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1094  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.39 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.69 
 
 		 671 aa  228  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 		 322 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.79 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>