More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2974 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  93.99 
 
 
183 aa  357  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  56.07 
 
 
186 aa  197  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
180 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
187 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  51.5 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  48.57 
 
 
187 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
187 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
193 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  51.98 
 
 
183 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  51.98 
 
 
183 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  51.98 
 
 
183 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  50.85 
 
 
183 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
205 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  41.9 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  39.41 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  38.82 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  39.41 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  39.41 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  39.41 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.41 
 
 
180 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  38.82 
 
 
180 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  38.82 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.82 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
286 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  33.92 
 
 
176 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  34.5 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  35.47 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31300  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.16 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00339223  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  34.08 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.16 
 
 
380 aa  90.5  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  32.56 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2029  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
428 aa  89  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.621487  normal  0.635347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2767  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158462 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5929  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
149 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  31.64 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
185 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1259  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2385  acetyltransferase, GNAT family  31.95 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000643226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  31.95 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  31.21 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2452  acetyltransferase  31.95 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000462654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  30.06 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4687  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535947  hitchhiker  0.00121502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  30.06 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2234  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000113859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.37 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  31.65 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000924532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  29.48 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2214  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.09842e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2438  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.144947 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2420  acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>