42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2038 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  90.7 
 
 		 516 aa  975    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1052    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  52.85 
 
 		 517 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1903  protein of unknown function DUF945  49.71 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  44.08 
 
 		 514 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  44.08 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  43.88 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  46.14 
 
 		 509 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  39.68 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  39.44 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  39.44 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  39.44 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  39.36 
 
 		 502 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  39.17 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  39.04 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  39.17 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  39.17 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  39.24 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  39.24 
 
 		 502 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  39.24 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  39.04 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  39.04 
 
 		 502 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  40.32 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5451  hypothetical protein  25.7 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.685296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5005  hypothetical protein  24.8 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4154  hypothetical protein  25.3 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00208158  hitchhiker  0.0000186661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4379  hypothetical protein  25.1 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000924151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4125  protein of unknown function DUF945  25.1 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5302  hypothetical protein  25.3 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0147516  normal  0.759699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03747  hypothetical protein  24.9 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03696  hypothetical protein  24.9 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.142182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4085  hypothetical protein  25.1 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000267659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4334  hypothetical protein  24.8 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.478027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0176  hypothetical protein  25.1 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3982  hypothetical protein  24.38 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1259  hypothetical protein  24.02 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1230  hypothetical protein  23.83 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4188  hypothetical protein  23.47 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2685  hypothetical protein  23.08 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0999  hypothetical protein  43.18 
 
 		 89 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.993783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>