16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0999 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0999  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  184  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.993783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  40.82 
 
 
514 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  40.82 
 
 
514 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  40.82 
 
 
514 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  41.3 
 
 
509 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2038  hypothetical protein  43.18 
 
 
516 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  50 
 
 
516 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  41.82 
 
 
502 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>