More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1317 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  73.29 
 
 		 454 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  72.81 
 
 		 456 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  72.37 
 
 		 456 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  72.37 
 
 		 456 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  67.69 
 
 		 470 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  77.85 
 
 		 457 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  73.03 
 
 		 456 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  73.25 
 
 		 456 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  75.88 
 
 		 456 aa  739    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  75.88 
 
 		 457 aa  736    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  73.03 
 
 		 456 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  77.41 
 
 		 457 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  72.59 
 
 		 456 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  72.59 
 
 		 456 aa  715    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  72.81 
 
 		 456 aa  718    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  73.25 
 
 		 456 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  68.42 
 
 		 454 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  100 
 
 		 457 aa  945    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  77.41 
 
 		 457 aa  754    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  73.36 
 
 		 456 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  73.46 
 
 		 455 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  72.37 
 
 		 456 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  67.1 
 
 		 463 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  75.67 
 
 		 460 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  73.9 
 
 		 457 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  73.25 
 
 		 456 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  72.37 
 
 		 456 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  60.62 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  64.1 
 
 		 450 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  63.58 
 
 		 454 aa  614  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  63.82 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  64.54 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  63.66 
 
 		 450 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  59.46 
 
 		 486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  60 
 
 		 486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  63.19 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  61.69 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  60.3 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  60.3 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  60.3 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  60.49 
 
 		 813 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  60.57 
 
 		 453 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  60.18 
 
 		 456 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  57.17 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  58.11 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  59.65 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  57.23 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  57.58 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  56.61 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  58.44 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  58.22 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  53.85 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  53.56 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  56.19 
 
 		 448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  56.26 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  56.26 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  53.35 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  53.72 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  51.06 
 
 		 497 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  50.96 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  52.58 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  49.01 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  48.44 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  73.05 
 
 		 282 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  40.71 
 
 		 447 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  40.58 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  40.7 
 
 		 456 aa  342  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  40.42 
 
 		 448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  40.18 
 
 		 448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  39.87 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.4 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  38.8 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.46 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  39.87 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  39.96 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  37.28 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  38.8 
 
 		 450 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  39.21 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  39.17 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.08 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  37.58 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  37.42 
 
 		 497 aa  295  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.72 
 
 		 455 aa  296  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.18 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.44 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  38.07 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  39.09 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  37.96 
 
 		 472 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  37.96 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.84 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.84 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  36.38 
 
 		 529 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.61 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  36.49 
 
 		 502 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.36 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  38.33 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  41.21 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  35.64 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  38.1 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>