19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  98.36 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  74 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  74 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  51.85 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  41.38 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  52.17 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  48.84 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  39.22 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  40.38 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  44.26 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>