77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  97.06 
 
 		 214 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  33.66 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  38.64 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  34 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.08 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.96 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  37.21 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  30.19 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  30.19 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  38.78 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  50 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  29.03 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  36.08 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  29.35 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  31.46 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  31.11 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  30.59 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  32.26 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  38.81 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  41.79 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  31.87 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  40.74 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  32.56 
 
 		 311 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  31.68 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  39.68 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  39.68 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  39.68 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  39.68 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  39.68 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  41.67 
 
 		 289 aa  44.3  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  36.36 
 
 		 269 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  30.11 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0591  putative potassium channel protein  35.24 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0599184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  41.82 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  32.35 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  50 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  31.31 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4786  putative potassium channel protein  34.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0423111  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0540  putative potassium channel protein  34.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  44.68 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  35.71 
 
 		 244 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  34.29 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0446  LCTB protein, potassium channel  34.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0442  LCTB protein, potassium channel  34.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  33.33 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0518  putative potassium channel protein  34.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000436021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0590  potassium channel protein, putative  34.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0451  Ion transport 2 domain-containing protein  32.38 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  44.68 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  44.68 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  44.68 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0535  potassium channel protein  34.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0211593  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  34.29 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  44.68 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0503  potassium channel protein  34.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  31.15 
 
 		 428 aa  40.8  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.71 
 
 		 409 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  34.29 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  50 
 
 		 288 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  31.33 
 
 		 311 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  36.96 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  39.13 
 
 		 295 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.14 
 
 		 367 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  44.44 
 
 		 288 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  38 
 
 		 277 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  34.15 
 
 		 419 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  38.46 
 
 		 277 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>