28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  88.45 
 
 
252 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  71.89 
 
 
250 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  57.03 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  52.97 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  44.88 
 
 
264 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  43.19 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  40.68 
 
 
246 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  39.04 
 
 
241 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  41.79 
 
 
250 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  39.09 
 
 
255 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  41.85 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  36.25 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  39.48 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  40.72 
 
 
221 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  39.23 
 
 
244 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  41.33 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  37.32 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  40.66 
 
 
220 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  38.07 
 
 
202 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  42.78 
 
 
218 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  30.25 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  31.09 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  31.09 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  32.23 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  37.07 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  30.25 
 
 
233 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>