216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  79.8 
 
 
398 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  814    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  79.08 
 
 
399 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  98.99 
 
 
398 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  79.28 
 
 
398 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  79.44 
 
 
396 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  78.87 
 
 
405 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  80.31 
 
 
394 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  79.79 
 
 
394 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  77.92 
 
 
394 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  79.53 
 
 
394 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  56.16 
 
 
371 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  51.85 
 
 
399 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  52.14 
 
 
394 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  55.14 
 
 
372 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  53.59 
 
 
387 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  50.83 
 
 
387 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  49.72 
 
 
392 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  52.19 
 
 
363 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  49.31 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  49.31 
 
 
397 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  48.7 
 
 
402 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  36.98 
 
 
349 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  36.98 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  36.98 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  36.98 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  36.69 
 
 
349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  36.69 
 
 
349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  37.01 
 
 
349 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  39.77 
 
 
342 aa  248  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  41.47 
 
 
357 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  35.92 
 
 
345 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  36.72 
 
 
349 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  36.98 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  36.72 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  36.12 
 
 
349 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  37.54 
 
 
343 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  37.54 
 
 
343 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  36.55 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  36.5 
 
 
340 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  33.82 
 
 
340 aa  202  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  34.2 
 
 
363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  31.66 
 
 
344 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  29.86 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  26.48 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  27.91 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  26.65 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  26.25 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  26.14 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  28.64 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  26.95 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  27.91 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  28.41 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  25.48 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  28.37 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  29.46 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  27.02 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  27.35 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  27.34 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  25.21 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  26.29 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  24.63 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  26.27 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  26.86 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3132  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  28.09 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  24.32 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  22.57 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  23.61 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  28.09 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  27.73 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  22.77 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1758  peptidase M42 family protein  26.06 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  23.26 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  21.91 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  23.93 
 
 
351 aa  67  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  25 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  28.1 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  23.72 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  25.62 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  24.06 
 
 
358 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1701  peptidase M42 family protein  26.33 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  30.04 
 
 
350 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  26.58 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  26.92 
 
 
362 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  26.7 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  22.49 
 
 
332 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  27.56 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  25.62 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  25.1 
 
 
353 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  27.8 
 
 
353 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  27.69 
 
 
339 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  23.95 
 
 
355 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  24.45 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.99 
 
 
356 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0174  glutamyl-aminopeptidase  26.67 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  24.81 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.57 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  29.17 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  22.47 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>