53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17631 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  67.28 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  62.8 
 
 		 180 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  40.12 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  34.02 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  36.25 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  42.03 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  28.74 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  34.72 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  37.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  38.76 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  32.57 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  40.44 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  34.03 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  39.86 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  34.97 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  34.97 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  35.17 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  33.92 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  34.62 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  32.06 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  28.74 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  32.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  31.06 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  31.06 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  31.06 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  32.64 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  32.05 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  33.9 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  36.15 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  25.32 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  29.86 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  25.86 
 
 		 396 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.75 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  33.86 
 
 		 256 aa  44.7  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  29.2 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 287 aa  41.2  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  24.14 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  33.98 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>