110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04181 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  98.08 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  92.72 
 
 		 261 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  80.16 
 
 		 259 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  58.4 
 
 		 266 aa  294  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  54.76 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  54.98 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  50.39 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  47.62 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  46.25 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  28.42 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  32.79 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  30.3 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  29.5 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  34.81 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  28.73 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  21.74 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  28.83 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  34.26 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.94 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  24.21 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  24.21 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  26.37 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  31.62 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  36 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  36.84 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  24.61 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  34.67 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  32.46 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  36 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  36.84 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  20.87 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  23.56 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  32.22 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  34.15 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  20.46 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  32.89 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  32.63 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  36.36 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  27.98 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  28.14 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  29.47 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  32.93 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  32 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  34.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  32.89 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  25.29 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  25.38 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  29.47 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  31.58 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  24.68 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  29.47 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  25.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  30.53 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.77 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  23.88 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  37.08 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.57 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  21.88 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  30.11 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  32.89 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>