178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0037 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0070  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.45639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0051  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.205109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0008  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0066  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 120 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0045  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0061  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0065  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0010  5S ribosomal RNA  91.3 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.629957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0021  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000104076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0078  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000574865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 121 bp  56  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 118 bp  56  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0016  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0035  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 132 bp  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 132 bp  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 122 bp  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0015  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0030  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0040  5S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.273793  normal  0.319704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0021  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0015  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0168638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0010  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00985283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0039  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0081  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000871424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0057  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0027  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000434608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0086  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0096  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000182454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>