269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3003 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3003  adenosine deaminase  100 
 
 
330 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  30.33 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  32.14 
 
 
341 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  32.46 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  32.73 
 
 
333 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  31.63 
 
 
346 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  32.17 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  30.21 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  29.17 
 
 
361 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  31.46 
 
 
336 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  29.02 
 
 
335 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  31.63 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  28.31 
 
 
341 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  28.11 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  30.65 
 
 
341 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  29.71 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  31.5 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  30.36 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  29.12 
 
 
338 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.53 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  31.76 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  29.74 
 
 
352 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.55 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  31.78 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.87 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  29.43 
 
 
341 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  28.74 
 
 
343 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  29.43 
 
 
341 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  29.91 
 
 
341 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  31.16 
 
 
351 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  29.43 
 
 
682 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  29.43 
 
 
682 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  32.36 
 
 
348 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  30.06 
 
 
341 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  31.97 
 
 
327 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  27.76 
 
 
349 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  30.03 
 
 
329 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  28.49 
 
 
346 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  29.27 
 
 
342 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  32.26 
 
 
327 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  27 
 
 
332 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  30.84 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  32.5 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  29.94 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  29.82 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  30.53 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  28.24 
 
 
353 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  33.22 
 
 
322 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  28.94 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  29.26 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  34.01 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  30.93 
 
 
332 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  28.23 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  31.83 
 
 
343 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  30.72 
 
 
337 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  28.75 
 
 
350 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  32.68 
 
 
327 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  27.66 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  27.44 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  27.33 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  30.3 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  28.79 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  29.17 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  29.17 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  29.59 
 
 
341 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  24.62 
 
 
330 aa  116  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  28.31 
 
 
336 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  27.99 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  28.62 
 
 
338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  28.62 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  29.64 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  29.45 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  28.71 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  27.19 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  29.62 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  28.62 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  29.03 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  28.01 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  25.9 
 
 
341 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  28.71 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  31.85 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  28.22 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  41.26 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  31.48 
 
 
331 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  41.26 
 
 
331 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  31.48 
 
 
331 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  29.17 
 
 
339 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  40.79 
 
 
357 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  41.26 
 
 
331 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  28.9 
 
 
335 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  26.41 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  31.48 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>