More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1481 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1481  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.33 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0941  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.31 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  47.46 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
174 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2895  peptidylprolyl isomerase  44.72 
 
 
167 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.88 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3255  Peptidylprolyl isomerase  44.19 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.29 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2910  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.79 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3186  Peptidylprolyl isomerase  46.79 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.611453  normal  0.130701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.93 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3652  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  38.41 
 
 
297 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.6 
 
 
310 aa  107  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1790  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50.93 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0774  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.85 
 
 
238 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0874  peptidylprolyl isomerase  48.25 
 
 
199 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.3353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4380  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.75 
 
 
302 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300595  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.85 
 
 
237 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0607  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  41.18 
 
 
206 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000591521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.75 
 
 
143 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0293  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.34 
 
 
231 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6027  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.55 
 
 
304 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0713688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0221  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.43 
 
 
140 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3860  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
159 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  51.33 
 
 
140 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0384  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.36 
 
 
278 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3481  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.95 
 
 
236 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3398  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  45.95 
 
 
237 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4021  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.45 
 
 
272 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3545  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  45.95 
 
 
236 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3841  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.45 
 
 
272 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0308  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.36 
 
 
283 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.254964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.05 
 
 
310 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00743  FKBP-type 22KD peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  41.26 
 
 
206 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4533  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50.47 
 
 
292 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4384  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.47 
 
 
112 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281199  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3736  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.45 
 
 
113 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2540  peptidylprolyl isomerase  47.79 
 
 
154 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5559  peptidylprolyl isomerase  50.45 
 
 
113 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0799  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.79 
 
 
138 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295735  normal  0.754912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.73 
 
 
310 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.94 
 
 
113 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150191  hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2929  peptidylprolyl isomerase  46.9 
 
 
154 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3683  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.73 
 
 
266 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3926  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.73 
 
 
266 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0270  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.73 
 
 
266 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.355026  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02370  FK506 binding protein 2, putative  53.33 
 
 
141 aa  98.2  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919131  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2474  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.75 
 
 
113 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
116 aa  97.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2350  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.96 
 
 
149 aa  97.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.47 
 
 
113 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4022  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  40.71 
 
 
256 aa  97.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
113 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  50.47 
 
 
113 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  50.47 
 
 
113 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2274  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
138 aa  97.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  49.53 
 
 
113 aa  97.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5187  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.02 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5467  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.35 
 
 
291 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.201374  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.75 
 
 
113 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3588  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  46.36 
 
 
243 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000438109  normal  0.302689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.75 
 
 
113 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2200  peptidylprolyl isomerase  46.9 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4646  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.02 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.02 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2362  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50 
 
 
157 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2816  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.02 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2871  peptidylprolyl isomerase  48.62 
 
 
112 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.824739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1033  Peptidylprolyl isomerase  49.09 
 
 
114 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1301  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.85 
 
 
210 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.907998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6832  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 
113 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.728971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1944  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.75 
 
 
240 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1481  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  38.78 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23499  predicted protein  53.33 
 
 
98 aa  94.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2604  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.61 
 
 
228 aa  94.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000092289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6522  Peptidylprolyl isomerase  48.15 
 
 
258 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2145  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  49.56 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1749  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  53.19 
 
 
107 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.372299 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01800  macrolide-binding protein FKBP12  46.67 
 
 
134 aa  94.4  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1524  peptidylprolyl isomerase  47.66 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2532  peptidylprolyl isomerase  46.9 
 
 
155 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3764  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.86 
 
 
273 aa  94  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00166525  hitchhiker  0.00369549 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9400  predicted protein  43.64 
 
 
133 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4556  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.15 
 
 
277 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000188469  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1803  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.63 
 
 
107 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05390  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-related protein  49.09 
 
 
157 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3463  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  44.14 
 
 
243 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2074  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  52.63 
 
 
107 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.801317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2573  peptidylprolyl isomerase  46.02 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1882  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  52.63 
 
 
107 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0305  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkpA precursor  44.55 
 
 
264 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0800  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.09 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000446702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3403  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.54 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000465734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0762  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.39 
 
 
234 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1049  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.54 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000578908  hitchhiker  0.00000145836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1206  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00153623  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3528  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.54 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000119299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3307  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  49.54 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000811964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>