More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30315 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_30315  Putative mitochondrial ribosomal protein L11  100 
 
 
152 aa  309  9e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
140 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
140 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  53.15 
 
 
142 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  52.99 
 
 
143 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  52.24 
 
 
143 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  49.26 
 
 
142 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01910  60s ribosomal protein l19, mitochondrial precursor, putative  46.53 
 
 
145 aa  146  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  53.19 
 
 
140 aa  146  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  51.75 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  52.45 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  50.74 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  52.45 
 
 
141 aa  144  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  52.48 
 
 
142 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  52.48 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  52.21 
 
 
142 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  52.21 
 
 
142 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  51.75 
 
 
141 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  52.21 
 
 
142 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  52.21 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  47.55 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
141 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0159  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
142 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000114645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
140 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  51.06 
 
 
143 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
142 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
143 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00116  mitochondrial ribosomal protein L11, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11830)  45.77 
 
 
153 aa  140  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00249815  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  48.25 
 
 
164 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
143 aa  140  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
142 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0188  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
142 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000110697  hitchhiker  0.00720013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0183  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
142 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0188  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
142 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00929078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0220  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
142 aa  140  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3770  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000004485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
143 aa  139  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
143 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
143 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 
142 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  53.33 
 
 
144 aa  140  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
143 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 
143 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
143 aa  139  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0189  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000123939  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  51.05 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  51.45 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4067  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738162  hitchhiker  0.00970321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0185  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4471  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  50.74 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  50.35 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  48.25 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  47.89 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  48.32 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  48.95 
 
 
141 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  46.85 
 
 
142 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
143 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>