59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2999 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  82.86 
 
 		 70 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  66.18 
 
 		 71 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  62.12 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  64.71 
 
 		 71 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  63.08 
 
 		 71 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  57.35 
 
 		 75 aa  84.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  54.69 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  51.56 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  44.93 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  40.85 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  45.31 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  45.31 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  47.69 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  38.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  37.31 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  36.51 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  36.11 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0554  SlyX  42.31 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  37.1 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  34.72 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  30 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  42.19 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5532  SlyX family protein  52.08 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438123  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  33.8 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  33.8 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  42.19 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  32.84 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  32.81 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  32.86 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  30.65 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  34.38 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  34.72 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  36.92 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  31.75 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  34.38 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  37.1 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  39.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  31.43 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0435  slyX protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  34.92 
 
 		 63 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  37.5 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2427  SlyX protein  46.03 
 
 		 67 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  35.94 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  37.84 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  35.94 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>