More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2611 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
198 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  56.57 
 
 
242 aa  214  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.16 
 
 
264 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.79 
 
 
247 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.73 
 
 
269 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.9 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.71 
 
 
248 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.41 
 
 
243 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.51 
 
 
239 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  36.36 
 
 
248 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  42.86 
 
 
250 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.32 
 
 
255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.57 
 
 
261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  37.26 
 
 
243 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.75 
 
 
244 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.35 
 
 
252 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  39.71 
 
 
216 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  42 
 
 
259 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.21 
 
 
233 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53 
 
 
168 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 
848 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.57 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  30.33 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  30.33 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.61 
 
 
681 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.9 
 
 
251 aa  74.7  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  29.86 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  37.96 
 
 
881 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.35 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.96 
 
 
881 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  31.73 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  31.73 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  31.73 
 
 
396 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.21 
 
 
881 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  31.73 
 
 
396 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  28.57 
 
 
381 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  28.57 
 
 
381 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.52 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  31.25 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.14 
 
 
962 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  25.24 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  26.13 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.89 
 
 
929 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.47 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.57 
 
 
605 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.34 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  34 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  31.22 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.5 
 
 
467 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.73 
 
 
687 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  27.96 
 
 
361 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.65 
 
 
752 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.47 
 
 
366 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  26.76 
 
 
396 aa  68.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 
588 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.71 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.85 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.34 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.71 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.71 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.22 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.01 
 
 
605 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  27.23 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  33.87 
 
 
678 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1359  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.73 
 
 
349 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000150243  hitchhiker  0.00000955183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.56 
 
 
687 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.19 
 
 
338 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.19 
 
 
339 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  26.24 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.94 
 
 
669 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.05 
 
 
676 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.93 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  40.62 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.75 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.34 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.47 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.09 
 
 
690 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.21 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.94 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.05 
 
 
662 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  40.22 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  30.65 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.21 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  30.29 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7253  ferredoxin  27.41 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  26.11 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.64 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.07 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  40.22 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.05 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.13 
 
 
340 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>