31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2624 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  52.46 
 
 
62 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  46.55 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  46.55 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  50.91 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  48.33 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  39.22 
 
 
66 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  44.23 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  39.62 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  43.4 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  55 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  48.98 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  51.72 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  48.08 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  40.43 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  48.84 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  42.55 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  40.43 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  43.4 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  34.04 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  38.98 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  36 
 
 
497 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  34.48 
 
 
481 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1316  hypothetical protein  52.54 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.153432  normal  0.0791201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>