40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1850 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  74 
 
 		 150 aa  250  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  72.67 
 
 		 150 aa  243  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  72 
 
 		 150 aa  241  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  72 
 
 		 150 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  68.67 
 
 		 150 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  68.67 
 
 		 150 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  58.67 
 
 		 150 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  60.67 
 
 		 150 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  60 
 
 		 150 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  60 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  53.33 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  54.67 
 
 		 147 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  52.67 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  55.33 
 
 		 149 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  55.33 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  54 
 
 		 146 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  53.33 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  51.33 
 
 		 141 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  52 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  54.11 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  54 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  52.67 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  49.01 
 
 		 142 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  39.73 
 
 		 277 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 238 aa  94.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  34.93 
 
 		 272 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  35.94 
 
 		 290 aa  90.9  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  35.94 
 
 		 290 aa  90.9  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  33.79 
 
 		 253 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  29.48 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  25.38 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  33.33 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  28.07 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 346 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 367 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 311 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.39 
 
 		 370 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  30.53 
 
 		 291 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>