More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1582 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  45.7 
 
 		 759 aa  670    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.96 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.97 
 
 		 752 aa  882    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  56.98 
 
 		 749 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  45.84 
 
 		 759 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  44.74 
 
 		 759 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  46.65 
 
 		 756 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  45.77 
 
 		 760 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  46.3 
 
 		 754 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  54.97 
 
 		 758 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  45.37 
 
 		 751 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  50.58 
 
 		 771 aa  798    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  54.22 
 
 		 750 aa  780    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  45.98 
 
 		 764 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  57.31 
 
 		 779 aa  885    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  45.12 
 
 		 751 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  45.7 
 
 		 761 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  44.29 
 
 		 759 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  44.27 
 
 		 764 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  47.09 
 
 		 761 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  44.49 
 
 		 779 aa  642    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  46.2 
 
 		 766 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  45.64 
 
 		 758 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  48.91 
 
 		 754 aa  748    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  44.83 
 
 		 759 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  44.94 
 
 		 763 aa  649    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  46.42 
 
 		 764 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  48.19 
 
 		 763 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  46.67 
 
 		 773 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  45.43 
 
 		 769 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  45.7 
 
 		 759 aa  670    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  100 
 
 		 783 aa  1591    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  49.61 
 
 		 763 aa  750    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.37 
 
 		 759 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  45.84 
 
 		 779 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  46.19 
 
 		 756 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  45.85 
 
 		 759 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  46.06 
 
 		 756 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  57.46 
 
 		 752 aa  894    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  45.57 
 
 		 757 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  58.48 
 
 		 752 aa  875    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  48.4 
 
 		 766 aa  745    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  46.13 
 
 		 753 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  45.96 
 
 		 759 aa  670    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  46.41 
 
 		 756 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  53.68 
 
 		 771 aa  796    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  46.3 
 
 		 756 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  48.96 
 
 		 754 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  45 
 
 		 759 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  44.82 
 
 		 758 aa  639    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  44.3 
 
 		 754 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  45 
 
 		 769 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.49 
 
 		 757 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  57.7 
 
 		 749 aa  877    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  55.86 
 
 		 749 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  48.06 
 
 		 763 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  55.1 
 
 		 758 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.64 
 
 		 760 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  53.55 
 
 		 771 aa  795    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  55.71 
 
 		 749 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  46.67 
 
 		 756 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  53.16 
 
 		 773 aa  788    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  45.85 
 
 		 759 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  45.96 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  44.27 
 
 		 777 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  44.6 
 
 		 773 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  45.96 
 
 		 759 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  52.3 
 
 		 751 aa  753    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  50.64 
 
 		 761 aa  777    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  47.34 
 
 		 754 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  45.96 
 
 		 759 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  46.06 
 
 		 756 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  57.57 
 
 		 749 aa  873    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  58.94 
 
 		 752 aa  887    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  47.15 
 
 		 761 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  49.74 
 
 		 757 aa  761    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  56.98 
 
 		 780 aa  887    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  44.4 
 
 		 764 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  46.07 
 
 		 764 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  45.38 
 
 		 776 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  48.68 
 
 		 753 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  53.68 
 
 		 771 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  47.66 
 
 		 761 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  46.43 
 
 		 756 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  46.83 
 
 		 761 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  46.08 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  45.31 
 
 		 759 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  46.06 
 
 		 756 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  45.85 
 
 		 759 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  45.72 
 
 		 759 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  57.58 
 
 		 757 aa  842    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  45.96 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  45.85 
 
 		 759 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  45.75 
 
 		 760 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>