24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1150 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  52.11 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  43.3 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  29.04 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  29.65 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  28.35 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  29.3 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  28.46 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  28.35 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  28.88 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  28.53 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  28.29 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  28.47 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  27.89 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  24.71 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  32.23 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  22.63 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  28.69 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  26.98 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  27.87 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  27.87 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  27.87 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  27.59 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>