191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2445 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  49.8 
 
 
241 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.73 
 
 
236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  45.73 
 
 
236 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  45 
 
 
246 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.06 
 
 
236 aa  204  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  44.96 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  44.86 
 
 
246 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.25 
 
 
241 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.7 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.25 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.67 
 
 
272 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
245 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  44.39 
 
 
233 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
245 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
242 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  43.66 
 
 
248 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  43.66 
 
 
248 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  42.37 
 
 
242 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  42.37 
 
 
242 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  43.6 
 
 
248 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  42.19 
 
 
237 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  41.53 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  41.53 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  41.53 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  41.53 
 
 
242 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  41.53 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.67 
 
 
247 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
240 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  41.91 
 
 
242 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  44.5 
 
 
249 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  40.85 
 
 
246 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  42.34 
 
 
252 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  39.29 
 
 
235 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.74 
 
 
272 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.04 
 
 
272 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  41.78 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  41.42 
 
 
238 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  40.57 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.7 
 
 
237 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  36.68 
 
 
238 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 
256 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  36.55 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  36.24 
 
 
282 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  36.32 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  38.31 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.6 
 
 
242 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30 
 
 
245 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.76 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.1 
 
 
237 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.45 
 
 
245 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.7 
 
 
254 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.57 
 
 
255 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.45 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  27.2 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  34.36 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  28.44 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.66 
 
 
210 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.69 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.37 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  28.76 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  33.13 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.05 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  25.21 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.51 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.6 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  28.71 
 
 
265 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  26.21 
 
 
260 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  29.69 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.79 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  28.26 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.8 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  29.76 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  25.21 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.59 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.13 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  29.08 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  28.32 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  27.49 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  27.49 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  27.13 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  26.48 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  26.44 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.73 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  29.13 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.96 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.23 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  28.11 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.32 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.61 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.32 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>