More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2419 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2419  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  54.39 
 
 
216 aa  193  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
219 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  50.88 
 
 
219 aa  185  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  52.05 
 
 
190 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  49.12 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
218 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  49.12 
 
 
226 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  50.29 
 
 
203 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  48.85 
 
 
210 aa  178  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  50.29 
 
 
198 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  47.98 
 
 
203 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 
190 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  49.14 
 
 
209 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
258 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
214 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  47.16 
 
 
190 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
236 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  47.4 
 
 
203 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
242 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  48.85 
 
 
199 aa  175  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  50.29 
 
 
200 aa  175  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  49.42 
 
 
209 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
292 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  49.42 
 
 
209 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 
209 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
292 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
292 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
292 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
292 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 
210 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  50.29 
 
 
219 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  53.22 
 
 
220 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 
211 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  49.42 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 
211 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 
211 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  49.42 
 
 
212 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  44.83 
 
 
206 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 
188 aa  174  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  50.3 
 
 
206 aa  174  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  48.28 
 
 
190 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  47.13 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  46.78 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  47.7 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  48.4 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  49.14 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  49.12 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
206 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  45.98 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  49.13 
 
 
202 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 
213 aa  170  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0634  GTP cyclohydrolase I  44.57 
 
 
172 aa  170  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 
202 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 
198 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  46.78 
 
 
211 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  43.1 
 
 
179 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  50.87 
 
 
200 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  47.13 
 
 
187 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  44.57 
 
 
213 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  49.13 
 
 
200 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 
234 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  49.42 
 
 
211 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  49.14 
 
 
214 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  47.67 
 
 
205 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  46.89 
 
 
195 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  44.25 
 
 
185 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  45.61 
 
 
219 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  47.98 
 
 
194 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 
199 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  48 
 
 
214 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  45.93 
 
 
204 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  47.13 
 
 
239 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  47.13 
 
 
239 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 
202 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  47.65 
 
 
201 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 
201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  47.67 
 
 
200 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 
201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 
201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  45.03 
 
 
197 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  43.1 
 
 
201 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
213 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
227 aa  165  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  48 
 
 
219 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 
195 aa  164  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  48.37 
 
 
216 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  43.75 
 
 
269 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  43.75 
 
 
269 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  43.86 
 
 
213 aa  164  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  45.35 
 
 
206 aa  164  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>