38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0298 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  698    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  35.77 
 
 
591 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  37.72 
 
 
423 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 
746 aa  159  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  33.62 
 
 
488 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  34.06 
 
 
469 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  36.13 
 
 
452 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  36.13 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.94 
 
 
1182 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
1239 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  32.02 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  33.88 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  28.68 
 
 
678 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.18 
 
 
418 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  33.05 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  33.16 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1185 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
673 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  29.96 
 
 
425 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  28.29 
 
 
294 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  30.9 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  31.72 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
1991 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  27.36 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  27.71 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  29.54 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  26.55 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  28.14 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  29.93 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  30.49 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  33.96 
 
 
289 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  28.88 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  27.08 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01331  hypothetical protein  26.9 
 
 
972 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  25.79 
 
 
769 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  29.59 
 
 
1209 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  20.74 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>