More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1622 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  741    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  70.51 
 
 
361 aa  536  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.45 
 
 
341 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
339 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 
342 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.12 
 
 
342 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.82 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
342 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
340 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
350 aa  222  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.59 
 
 
342 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
340 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
340 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
360 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.1 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  35.1 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.99 
 
 
342 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.81 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.69 
 
 
342 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
342 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.05 
 
 
342 aa  192  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.73 
 
 
346 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
342 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 
340 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 
340 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
340 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.84 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.02 
 
 
340 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
337 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
339 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
339 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
347 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
352 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
430 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
339 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
341 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  30.42 
 
 
435 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
345 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  28.85 
 
 
418 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  29.3 
 
 
429 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  30.03 
 
 
430 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
338 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
430 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 
341 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  28.9 
 
 
430 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
337 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
325 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
325 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  28.33 
 
 
426 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.1 
 
 
331 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.83 
 
 
359 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  28.3 
 
 
325 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  27.86 
 
 
432 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
325 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
333 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.4 
 
 
325 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  28.21 
 
 
427 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  28.19 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.65 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  27.84 
 
 
432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  28.12 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  27.84 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.42 
 
 
326 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
330 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  28.4 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.77 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  29.86 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  28.22 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
332 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
329 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  28.61 
 
 
328 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.49 
 
 
325 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  27.95 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.59 
 
 
337 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  28.87 
 
 
424 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.77 
 
 
332 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  28.72 
 
 
451 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.23 
 
 
338 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
328 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
331 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
325 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  27.48 
 
 
421 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  28.23 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.14 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  28.99 
 
 
427 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
332 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.22 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.3 
 
 
327 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
357 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>