15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2179 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  100 
 
 
310 aa  617  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  84.15 
 
 
404 aa  292  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  70.33 
 
 
401 aa  248  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  68.82 
 
 
405 aa  228  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  66.47 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  47.62 
 
 
399 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  41.45 
 
 
400 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  45.29 
 
 
410 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  42.63 
 
 
399 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  41.36 
 
 
402 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  35.98 
 
 
190 aa  108  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  31.9 
 
 
184 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  36 
 
 
214 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  41.3 
 
 
720 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>