251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3024 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  100 
 
 
356 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  54.35 
 
 
255 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  56.7 
 
 
253 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  51.05 
 
 
258 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  50.43 
 
 
236 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  50.63 
 
 
268 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.09 
 
 
235 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  51.09 
 
 
235 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.9 
 
 
257 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  43.86 
 
 
251 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.72 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  43.97 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  46.09 
 
 
260 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  45.61 
 
 
266 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  42.24 
 
 
247 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
244 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  42.21 
 
 
257 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  40.57 
 
 
280 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  41.78 
 
 
259 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  40.35 
 
 
245 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  39.19 
 
 
249 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.73 
 
 
260 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  39.47 
 
 
245 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.84 
 
 
264 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  43.17 
 
 
215 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
265 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  41.78 
 
 
264 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  39.64 
 
 
255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  38.33 
 
 
208 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  36.65 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  37.13 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  41.58 
 
 
249 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
243 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  41.33 
 
 
224 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  38.91 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  41.33 
 
 
224 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  40.89 
 
 
234 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  33.63 
 
 
209 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.4 
 
 
244 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  39.57 
 
 
224 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  34.85 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  35.47 
 
 
223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  37.05 
 
 
269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  40.43 
 
 
221 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  34.26 
 
 
230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
213 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  37.12 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  40.83 
 
 
221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.74 
 
 
213 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35 
 
 
219 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  38.29 
 
 
253 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  38.46 
 
 
208 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  37.99 
 
 
221 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
233 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
233 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
236 aa  99.4  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  31.84 
 
 
227 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
243 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
234 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
234 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
234 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  30.25 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  35 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  31.22 
 
 
234 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 
234 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  30.96 
 
 
238 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  30.64 
 
 
234 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.64 
 
 
234 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  31.84 
 
 
228 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
230 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
231 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.64 
 
 
248 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.64 
 
 
248 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
250 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  34.03 
 
 
230 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  33.91 
 
 
238 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
251 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
243 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.61 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
830 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.69 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0475  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0816105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
859 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  29.04 
 
 
847 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  29.32 
 
 
847 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  28.24 
 
 
243 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
850 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30 
 
 
853 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  26.32 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>