More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2765 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2765  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
432 aa  889    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
961 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
718 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.81 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  26.05 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.85 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
401 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  27.68 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  34.15 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  25.65 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
340 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
360 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
386 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
394 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  38.37 
 
 
384 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.2 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
445 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
361 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
377 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  25.22 
 
 
377 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  25.22 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.68 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  25.41 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
361 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.1 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
370 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
408 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.11 
 
 
466 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2136  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
362 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
373 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
748 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
743 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>