58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4885 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  76.36 
 
 		 115 aa  171  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  84.85 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  80.43 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  75.53 
 
 		 108 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  71.74 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  70.33 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  52.08 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  54.76 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  41.05 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  34.52 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  32.63 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  33.64 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 243 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 298 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  33.33 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  30.39 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  35.8 
 
 		 242 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  31.58 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  31.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 124 aa  40  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 156 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>