127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1109 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  64.02 
 
 		 804 aa  954    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.83 
 
 		 1314 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.44 
 
 		 1088 aa  758    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  52.2 
 
 		 1215 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  60.69 
 
 		 713 aa  803    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  59.18 
 
 		 794 aa  902    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.2 
 
 		 1053 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  52.2 
 
 		 1215 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  52.33 
 
 		 1225 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  53.64 
 
 		 807 aa  766    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  51.27 
 
 		 807 aa  744    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  52.2 
 
 		 1215 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  51.21 
 
 		 1186 aa  719    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  50.97 
 
 		 1327 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  47.08 
 
 		 807 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  100 
 
 		 788 aa  1581    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41.55 
 
 		 1055 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.4 
 
 		 1051 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.18 
 
 		 1050 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.93 
 
 		 1053 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.47 
 
 		 1051 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.83 
 
 		 1052 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41 
 
 		 1053 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.34 
 
 		 1125 aa  602  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  37.26 
 
 		 904 aa  515  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  38.24 
 
 		 806 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  34.14 
 
 		 769 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.5 
 
 		 780 aa  331  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  31.67 
 
 		 755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.36 
 
 		 775 aa  301  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  50.39 
 
 		 450 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.73 
 
 		 763 aa  288  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.71 
 
 		 748 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  29.59 
 
 		 807 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  27.6 
 
 		 778 aa  278  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 978 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 759 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.92 
 
 		 789 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  27.79 
 
 		 769 aa  271  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.72 
 
 		 720 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.33 
 
 		 787 aa  263  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.34 
 
 		 781 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  26.94 
 
 		 965 aa  257  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  27.44 
 
 		 780 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  27.6 
 
 		 794 aa  252  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  28.08 
 
 		 787 aa  250  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  30.82 
 
 		 790 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  30.41 
 
 		 790 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  29.17 
 
 		 755 aa  243  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.65 
 
 		 759 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  29.15 
 
 		 755 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  29.15 
 
 		 755 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  29.2 
 
 		 755 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  35.34 
 
 		 760 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.88 
 
 		 762 aa  240  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.37 
 
 		 777 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  29.02 
 
 		 755 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  29.02 
 
 		 755 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.89 
 
 		 755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  29.69 
 
 		 755 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 858 aa  235  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.97 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  29.93 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  29.8 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  29.58 
 
 		 795 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.73 
 
 		 825 aa  227  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  29.74 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  26.79 
 
 		 774 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  26.1 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 		 780 aa  218  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.77 
 
 		 749 aa  217  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  29.45 
 
 		 704 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.17 
 
 		 771 aa  210  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.47 
 
 		 753 aa  209  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  28.31 
 
 		 800 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  29.47 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  23.46 
 
 		 805 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  27.04 
 
 		 767 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.91 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  24.94 
 
 		 748 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  23.85 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  28.02 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.5 
 
 		 750 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.32 
 
 		 786 aa  191  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.88 
 
 		 848 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  30.14 
 
 		 780 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  25.28 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  27.65 
 
 		 776 aa  189  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  23.96 
 
 		 767 aa  187  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.97 
 
 		 843 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.47 
 
 		 807 aa  184  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  28.05 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.8 
 
 		 787 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  30.09 
 
 		 784 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  24.07 
 
 		 768 aa  180  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  29.55 
 
 		 791 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.09 
 
 		 786 aa  180  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  29.06 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>