24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0122 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  100 
 
 		 478 aa  970    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  55.21 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  49.88 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  48.08 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  44.49 
 
 		 499 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  48.82 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  48.08 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  45.33 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  42.95 
 
 		 447 aa  319  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  43.29 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  41.97 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  39.82 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  40.37 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  37.93 
 
 		 521 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  36.71 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  40.67 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  39.87 
 
 		 492 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  39.37 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  36.53 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  33.88 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  33.88 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  33.88 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  36.26 
 
 		 197 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  36.26 
 
 		 197 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>