More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5176 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  80.91 
 
 
244 aa  384  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  74.58 
 
 
242 aa  344  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  70.25 
 
 
259 aa  341  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  70.42 
 
 
243 aa  338  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  71.55 
 
 
257 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  68.58 
 
 
271 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  70.37 
 
 
270 aa  329  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.93 
 
 
264 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  69.17 
 
 
252 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  70.29 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.86 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.86 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  62.14 
 
 
258 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.76 
 
 
256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  63.41 
 
 
247 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  63.41 
 
 
247 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  63.64 
 
 
251 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 
249 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.07 
 
 
250 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.13 
 
 
252 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.93 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  50 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.93 
 
 
266 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
249 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
254 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  46.35 
 
 
240 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  46.44 
 
 
255 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  46.03 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  47.81 
 
 
239 aa  214  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
254 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 
273 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
256 aa  210  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
281 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
255 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
278 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
284 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
395 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
278 aa  205  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
281 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.3 
 
 
277 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.44 
 
 
398 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
453 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
440 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 
277 aa  197  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
283 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  43.78 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 
403 aa  195  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41 
 
 
310 aa  194  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
402 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 
456 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.67 
 
 
284 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 
411 aa  192  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
281 aa  191  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  41.1 
 
 
282 aa  191  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
281 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  38.14 
 
 
283 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.17 
 
 
276 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
541 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
285 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
288 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
285 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
285 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.33 
 
 
277 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  38.91 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.31 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 
279 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 
271 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  38.66 
 
 
380 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
248 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
267 aa  174  9e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  40.34 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
403 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  38.7 
 
 
275 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  36.97 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
300 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
276 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
280 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
280 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.59 
 
 
280 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  42.67 
 
 
571 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
282 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.59 
 
 
291 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.89 
 
 
574 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
255 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  37.19 
 
 
283 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  37.19 
 
 
283 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>