31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4638 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4638  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  45.11 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  38.14 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  34.44 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  25.81 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  25.81 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  33.63 
 
 		 366 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.36 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 147 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  36.04 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  36.22 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0593  hypothetical protein  31.45 
 
 		 136 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  32.04 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 367 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  32.04 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.01 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  28.1 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1853  hypothetical protein  27.59 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.163672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  28.85 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  32.32 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.36 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.46 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  33.61 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 356 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  27.56 
 
 		 165 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.86 
 
 		 359 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  35.44 
 
 		 342 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>